Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms