Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms