Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc12Q8K2L8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc12Q8K2L8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc12Q8K2L8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc12Q8K2L8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc12Q8K2L8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc12Q8K2L8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms