Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud6bQ8K2H2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud6bQ8K2H2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms