Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd3Q8K1Y2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms