Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nek9Q8K1R7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nek9Q8K1R7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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