Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700001C19RikQ8K168 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms