Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms