Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Znf628Q8CJ78 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Znf628Q8CJ78 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Znf628Q8CJ78 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Znf628Q8CJ78 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Znf628Q8CJ78 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Znf628Q8CJ78 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Znf628Q8CJ78 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Znf628Q8CJ78 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Znf628Q8CJ78 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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