Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms