Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Card11Q8CIS0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Card11Q8CIS0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Card11Q8CIS0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Card11Q8CIS0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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Card11Q8CIS0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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Card11Q8CIS0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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Card11Q8CIS0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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Card11Q8CIS0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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Card11Q8CIS0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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Card11Q8CIS0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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Card11Q8CIS0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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Card11Q8CIS0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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Card11Q8CIS0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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Card11Q8CIS0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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Card11Q8CIS0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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Card11Q8CIS0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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Card11Q8CIS0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms