Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Setd1bQ8CFT2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms