Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcinQ8CDE2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcinQ8CDE2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms