Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrif1Q8CDD9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrif1Q8CDD9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrif1Q8CDD9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrif1Q8CDD9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrif1Q8CDD9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrif1Q8CDD9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrif1Q8CDD9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrif1Q8CDD9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrif1Q8CDD9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms