Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RybpQ8CCI5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms