Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc5Q8CAL5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms