Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4aQ8C9S8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms