Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms