Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FarsaQ8C0C7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FarsaQ8C0C7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FarsaQ8C0C7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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FarsaQ8C0C7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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FarsaQ8C0C7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FarsaQ8C0C7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FarsaQ8C0C7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FarsaQ8C0C7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FarsaQ8C0C7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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