Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms