Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms