Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx17Q8BVL3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms