Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130116L18RikQ8BMV6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms