Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gga3Q8BMI3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms