Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc5a7Q8BGY9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc5a7Q8BGY9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc5a7Q8BGY9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Slc5a7Q8BGY9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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