Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg4dQ8BGV9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms