Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.2Q85ZW9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.2Q85ZW9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.2Q85ZW9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.2Q85ZW9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.2Q85ZW9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.2Q85ZW9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.2Q85ZW9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms