Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms