Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm5bQ80Y84 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms