Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnma8aQ80VM8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms