Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NischQ80TM9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NischQ80TM9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms