Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2q1Q7TSS2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms