Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms