Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prrc2bQ7TPM1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms