Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mycbp2Q7TPH6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms