Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbno2Q7TNB8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbno2Q7TNB8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbno2Q7TNB8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sbno2Q7TNB8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno2Q7TNB8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms