Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smap2Q7TN29 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smap2Q7TN29 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smap2Q7TN29 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smap2Q7TN29 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms