Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf139Q7TMV1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms