Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SynmQ70IV5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SynmQ70IV5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms