Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms