Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ino80Q6ZPV2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms