Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smpd4Q6ZPR5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms