Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc44a1Q6X893 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms