Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rhox8Q6VSS7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rhox8Q6VSS7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms