Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc57Q6PHN1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms