Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf316Q6PGE4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms