Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc82Q6PG04 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms