Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rasa4Q6PFQ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms