Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scaf4Q6PFF0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms