Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rad54bQ6PFE3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms